<ul id="catalog">
<li>
<a href="http://mashinkinn.loc/index.php?route=product/category&path=20_26">PC (0)</a>
</li>
<li>
<a href="http://mashinkinn.loc/index.php?route=product/category&path=20_27">Mac (1)</a>
</li>
</ul>
<li>
внутри <ul>
(по id). \(\d+\)
совпадает с открывающейся скобкой, одной или несколькими цифрами и закрывающейся скобкой. Эту регулярку заменять на совпавший фрагмент в теге <span>
:$('#catalog>li>a').each(function(){
$(this).html( function(i,t){
return t.replace(/(\(\d+\))/, '<span>$1</span>')
});
});
Fiddle