Конечно, Макконнелл "Совершенный код",
Мартин "Чистый код"
"Рефакторинг" Фаулера
"Приемы объектно-ориентированного проектирования" Э. Гамма
Поскольку в списке mysql -
High Performance MySQL обязателен к прочтению
Отдельно рекомендую "Регулярные выражения" Дж.Фриддла, отлично вправляет мозг по регуляркам.
По базам в целом:
короткая "Architecture of a Database System" J. M. Hellerstein, M. Stonebraker and J. Hamilton расскажет об общих подходах построения СУБД
Bill Karwin SQL_Antipatterns - как не надо писать SQL. А вот, кстати, отличный материал как надо писать, но не книга:
use-the-index-luke.com
Это всё вполне можно читать в порядке отдыха.
Фундаментальные, которые уже идут заметно тяжелее:
"Transactional Information Systems" Weikum, Vossen - монументальная теория транзакционной обработки
"Алгоритмы. Построение и анализ" Томас Х. Кормен, Чарльз И. Лейзерсон, Рональд Л. Ривест, Клиффорд Штайн - про основные алгоритмы. Всё библиотечное, но полезнейшая весь для понимания обычно скрытой машинерии и для прохождения собеседований.