Используем NGINX + PHP-FPM на всех Drupal проектах. Никаких проблем с этим не возникает.
Вопрос - у меня к примеру стоит nginx, и я хочу поставить nodejs. Не будет ли каких то камешков в колёсах от такого соседства?
Зависит того как сконфигурируете, но в целом проблем быть не должно.