как в php дату стандартного формата перевести в MySQL
нет такого понятия как стандартный формат, для каждой страны свой формат даты. По сути дела Вам нужно перевести дату из формата 'd.m.Y' в timestamp. Для это достаточно воспользоваться возможностями встроенного объекта Datetime, например:
$date = date_create_from_format('d.m.Y','21.03.2017');
echo $date->getTimestamp();