Со всей структурой восстановить уже, скорее всего, не получится, т.к. таблица файлов затерта.
Можно выполнить поиск по содержимому с помощью любой подходящей утилиты, например, R-Studio, должны найтись все известные типы файлов, но без пути и имени.
Разумеется, если форматирование было не полным.