Ох уж эти ставки. По ВЧ запросу в этом регионе оказывается никто не рекламируется CTR у Яндекса только прогнозируемый. А по СЧ запросу есть объявление, и видать с настолько низким CTR что Яндекс, опираясь на статистику занизил средний прогнозируемый CTR, который получают новые объявления для этого слова.
И еще, я не сразу обратил внимание, что списываемая цена отличается в обратную сторону, то есть как должно быть, хоть и не сильно. Так что все нормально.