Как ещё одна альтернатива rsync — заархивировать содержимое дисков сервера
tar, перенести архив, распаковать на новом месте и переустановить загрузчик.
У gentoo'шников это называется stage.
Здесь хорошо описана работа со stage5: как создать архив и как его развернуть — как раз то, что Вам надо (с некоторой поправкой на gentoo'шную специфику)
Но этот способ подойдёт если есть возможность загрузиться с любого LiveCD.
Такой способ лучше образов тем, что позволяет перенести систему на диски с принципиально другой разбивкой (и даже с другими файловыми системами).