Отрыть документацию/код плагина. Найти хуки, к которым можно прикрепить filter или action, сделать это в своей теме/своём плагине. То есть, вы вносите правки в чужой плагин через свою тему/плагин с помощью фильтров и экшенов. Но не факт, конечно, что автор плагина вообще прдусмотрел эту возможность.