После перезагрузки сервера
всегда слетает кодировка главной страницы JIRA.
Выглядит это примерно так:

Причем внутри – задачи, комментарии и т.п. в нормальной кодировке.
Помогает переустановка системы из бинарника atlassian-jira-core-7.3.0-x64.bin
Debian, PostgreSQL 9.4.9