Скорее всего, процесс FastCGI не видит имя сайта, которое ему передаёт Apache.
Оптимальный способ уменьшить нагрузку и упростить настройку - это переход на Nginx + PHP-FPM.
По неоднократному опыту, такой переход займёт меньше времени, чем отладка Апача.