Дмитрий Беляев пишет - абсолютно также, как для веба. Моё мнение: это не совсем так и верно в том случае, если веб у вас использует для фронтенда Angular или похожий фреймворк. Скорее всего, автор вопроса использует серверный рендеринг (mvc стиль - jade или аналогичный фреймворк).
Для работы с клиентами мобильных и десктопных приложений нужно писать REST сервисы. REST Api - это архитектура веб сервера, при которой в ответ на запросы пользователь получает не html страницу, а json или xml - форматированные данные модели, с которыми целевому приложению будет удобно работать.
Первое что советую сделать - переходить с express на более узкоспециализированные модули типа
restify. Возможно, вам понравится
feathers.