В таком нагреве хорошего мало, это всё издержки стремления к "быстрой" зарядке. В моём "умном" заряднике типа BC700 при установке зарядного тока 700 мА (это для него максимальный) аккумуляторы ощутимо греются, и это норма. При бОльшем токе нагрев будет больше, так что если ваш умеет давать бОльший ток, то не удивляйтесь.
А вот разница по отдельным каналам - это настораживает. Поменяйте местами нагревающиеся и негреющиеся и посмотрите, куда переместится нагрев. Если останется там же - виновен зарядник, если переместится - проблема в аккумуляторах (у них, изношенных, может быть повышенное внутреннее сопротивление).
И ещё: гонять аккумы на чрезмерных режимах нехорошо для их долговечности. Так что стремление к быстроте может выйти боком.