Могу посоветовать такую последовательность действий:
1. Сначала очищаете от всего лишнего SVG файлы с помощью онлайн утилиты
SVG-Editor автор
Peter Collingridge
Убирает всё лишнее. Пользуюсь много лет. Файл становится в разы меньше, качество изображения не страдает.
2. А дальше придется ручками присвоить каждой иконке свой id=" " и класс контейнеру, в который будет обернута иконка в HTML файле.
3.Далее при помощи команд
getElementById находите иконку и красите её
setAttribute("fill","yellowgreen")
4. Конкретные примеры ниже в ссылках
https://jsfiddle.net/Alexandr_T/7e6yka38/
https://jsfiddle.net/Alexandr_T/c7akqwjr/