Нету сервисов, ну по крайней мере я таких не знаю.
Посмотрите может можно выкинуть какие нибудь скрипты, к примеру у вас в одном шаблоне jquery2.11.3, а во втором jquery2.13.5, скорее всего если убрать jquery2.11.3, то более новое заменит старое. Так же имеет большое значение расположение скриптов, например:
<script src="assets/js/jquery.min.js"></script>
<script src="assets/js/bootstrap.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.lightbox-0.5.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.common.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/interface.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.watermark.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/modernizr.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/common.js"></script>
Так будет работать все, а вот так:
<script type="text/javascript" src="js/interface.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.watermark.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/modernizr.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/common.js"></script>
<script src="assets/js/jquery.min.js"></script>
<script src="assets/js/bootstrap.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.lightbox-0.5.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.common.js"></script>
Много чего работать не будет)