1) Какие есть индексы
В админке зайди в раздел обновления индексов и там будет их список
2) Что такое индексы
Таблицы с оптимизированными данными. Самый простой пример: есть у товаров базовая цена, а так же есть всякие скидки; если товар находится в группе (bundle), то у него может так же меняться цена и т.д. Т.е. чтобы получить конечную цену, надо делать доп. расчеты. Из-за того что в magento много всяких функциональных штук и приблуд типа EAV, делать расчеты крайне накладно. Поэтому делают индексацию, при которой все что надо рассчитывается и записывается в оптимизированном для выборок виде.