На мой взгляд очень отличаются. Сейчас у меня обе версии, первая дома, вторая на работе. Вот несколько пунктов, которые я до сих пор замечаю, когда пересаживаюсь первую версию, когда возвращаюсь со второй:
1. Ездит по столу, если, например, делать какой-нибудь длинный драг энд дроп. Вторая версия более "массивная" и таким недостатком не обладает.
2. Внезапно кончается рабочая поверхность. У второй версии вся поверхность сверху рабочая, кроме того она больше чем на первой.
3. "Блин, опять батарейки разрядились". Я использую первую версию с (купленными отдельно) перезаряжаемыми аккумуляторами в формате AA, когда они разряжаются нужно или иметь рядом замену, или ждать пока зарядятся. При этом нужно раскрутить не очень удобную заглушку и помнить о возможности разряда. Нужно ли упоминать, что пользоваться первым трекпадом пока единственные батареи заряжаются невозможно. У второй версии сзади есть лайтинг разъём, шнур от айфона всегда под рукой. Если, вдруг, трекпад разрядился - можно подключить его по USB, он будет и заряжаться и работать.
Force touch, присутствующий во второй версии я нахожу бесполезным или даже вредным (если не выключить). Единственное применение ему я нашёл при тестировании iOS приложений в симуляторе, но, честно говоря, такое я почти всегда тестирую на устройстве.
Выбор делайте сами, но, стоит отметить, что стоимость второй версии высока. Лично я, например, первую версию дома я не буду заменять на вторую. Но, как рабочий безотказный инструмент, оно того стоит.
Первый трекпад похож на трекпад MacBook Pro (без force touch), даже интереснее в плане большей рабочей поверхности. В тот же момент он не обладает такой массивностью, как трэкпад ноутбука.