Во многих CMS — контент генерируется динамически и файла index.html там быть не может. А может быть файл index.php. Не имея доступа по FTP, либо доступа в админку, вы сможете скопировать лишь сгенерированный HTML код, со стилями, картинками, js-скриптами (простите за тавтологию).
Если вы хотите знать файловую структуру сайта, то у выше описанного Teleport Pro есть функция выкачивания сайта с сохранением структуры папок и файлов.