Жаль что с опозданием, но может другим поможет:
При экспорте инфоблоков вы должны указать xml-файл экспорта (или csv). Например экспортировать инфоблок "Новости" из типа инфоблока "Новости" в файл news.xml, в таком случае будет создан/изменен существующий файл news.xml и будет создана папка news_export содержащая изображения из инфоблока (собственно их пути и будут прописаны в xml или csv)