ИМХО МФТИ > МГУ > ВШЭ.
Если вы действительно готовы потратить кучу времени на учебу, то мне кажется МФТИ будет лучшим вариантом. Он тоже известен за границей, хоть и поменьше, чем МГУ. И плюсом будет хороший CS в образовательной программе, в отличии от ММ МГУ.
Я слышал что в МГУ сейчас довольно много проблем: устаревшее образование (хотя к математике это слабо относится), непонятно, куда уходят деньги (общаги в ужасном состоянии) и т.п.
У меня есть друзья, учащиеся либо учившиеся в этих вузах на технических специальностях, но сам я там не учился и что-то конкретнее сказать не могу. Можете попробовать поискать в ВК студентов из этих вузов и поспрашивать их, потому что иначе провести сравнение сложно.