ADRian: Оно и не будет так переключать, ибо это внешний по отношению к проекту файл библиотеки. Переключение работает только по паре: если вы создадите в своём проекте файлы mainwindow.cpp и mainwindow.h и нажмёте F4, будучи в mainwindow.cpp, вас перекинет в mainwindow.h и наоборот.
В остальном случае используйте Alt + <- или Alt + ->
Навигации по qapplication.cpp/qtapplication.h не будет, так как это часть исходного кода другого проекта -- библиотеки Qt, которая от вас "сокрыта", пользуйтесь документацией по классам. В исходный код Qt'а заглядывать нужно довольно редко, разве что посмотреть реализацию тех или инных алгоритмов.
