Точки монтирования винда скорее всего прописывает в реестре. Узнайте где именно и в каком формате создается запись (можно методом тыка). Потом, загрузившись с лив диска, добавить в реестр нужную запись, перенести файлы на том, оставить пустой каталог.
Думаю с Program Files так должно получиться, с системной папкой - нет.
Но может пойти от обратного? Системный диск оставьте в покое - перенесите профили пользователей. Это делается легко и без ущерба для работы винды.
Так вы решите проблему с внезапным окончанием свободного места на системном диске. Если заинтересует - скажу что надо сделать.
Я давно уже не оставляю пользователей на системном диске. Проблемно может быть только перенесение профиля All users - на него ссылается куча сим.линков, но и это переносится - гугл в помощь.