Понимаю, что вопрос не новый, но может кто-нибудь в поисковике выйдет на него снова.
Здесь бы уточнить наверняка - есть настройки печати на самом ПК, и есть настройки в МФУ.
Уточняющий вопрос автору - двусторонняя печать отключена и там, и там, но при перезагрузке возвращается на включённое состояние?
По умолчанию драйвер ставит двустороннюю печать, всегда в один клик переставляем на одностороннюю.
Никогда такого не видел, чтобы настройка сама срывалась обратно.