Ubuntu автоматичски создала новый раздел
Трудно понять из такого сумбурного рассказа что вы там наделали ... но это не Ubuntu, это вы так насоздавали разделов. Чтобы понять, сделайте из Linux:
$ sudo fdisk -l /dev/sda
Или хотя бы отформатировать его не затрагивая убунту
Это можно всегда.
Но структура существующих разделов оставшаяся на диске зависит от того а). какой у вас стоял Windows и б). как он устанавливался (по умолчанию или при ручной разбивке).
Запустите программу gparted и посмотрите.