set noundofile
), но поступать так крайне не рекомендую. Лучше изменить директорию под их хранение с "относительно текущей" на что-нибудь абсолютное вне проекта (set undodir=
). Причем нужно иметь ввиду, что эта директория уже должна быть как-то создана и быть доступна для Vim, поскольку сам он её не создает.