Оформить php как сервис, в зависимости от того, какая система загрузки установлена читаnь документацию, upstart, systemd и т.п. во всех случаях это будет либо простейший скрипт (скопированный из примеров документации или из интернета) в котором вы укажете запуск своего php в виде запуска в цикле на том же bash - while(true);do php main.php;slep 1;done или на любом другом скриптовом языке, пусть и php.
Рекомендую реализовать хоть какой то контроль над причиной завершения работы вашего скрипта, через код ошибки, или свои средства логирования и состояния, и корректно отрабатывать ситуацию с ошибками, чтобы не получилось бесконечный запуск приложения с немедленным выходом (допускается остановка с отсылкой сообщения администратору или к примеру экспоненциальный рост времени между перезапуском, если это происходит сразу), но это общие советы с любыми вечноработающими приложениями.
