Такого не бывает.
Замена диска никак не может повлиять на устройства.
Вы видимо умудрились испортить образ системы при копировании, наверное переставлять систему придется.
Да, об Акронис ТИ ходят такие слухи, и хотя я ни разу на это не попадался, при подобных операциях, когда клонируется (или резервируется) особо важный диск, я делаю несколько образов разными прогами - не только акронисовской, но и "Духом Нортона", и парагоновскими.