Для тестирования на нескольких планшетах можно девелоперским сертификатом и профайлом привязать к нескольким планшетам и вообще без апстора обойтись, да. Есть какой-то еще вариант дистрибуции на заранее не привязанные устройства, но и не через апстор. Но точно про это не скажу.
А насчёт заливки - непонятно, что имеется ввиду. Технически как?
Я компилил приложение онлайн с помощью Adobe PhoneGap Build, подписывая своими дистрибьюшен-сертификатом. А потом уже заводил приложение на ItunesConnect, а IPA файл заливал ApplicationLoader-ом с помощью виртуального MacInCloud.
А вот от себя его публиковать или от заказчика...
Лучше наверное от заказчика. Особенно если приложение не бесплатное. Ну или уладить потом все вопросы перечислений и прочего...