Если вам нужна поддержка ie6-7-8, то в любом случае ваш выбор - первая версия.
Если нет - используйте вторую. Но разницу в скорости в типовых задачах вы вряд ли ощутите.
А еще проверьте, с какой версией совместимы те плагины, которые вы собираетесь использовать.