Согласен со всеми предыдущими ответами и добавлю свои 5 копеек. Можно Total Commander. Выбираете в нем файл ярлыка и нажимаете F4.
MiiNiPaa совершенно прав. Вам надо обратиться к файлу, минуя оболочку винды. Т.е. командной строкой, спец.прогой и даже банальным блокнотом, но с небольшими заморочками.
А для чего вам это требуется? Хотелось бы понять цель, чтобы можно было посоветовать что-то конкретное. Хотите написать "супер-коварный-вирус-меняющий-все-ярлыки-чтобы-они-запускали-второй-мега-коварный-вирус"? На самом деле, хотелось бы понять цель. Тогда наши ответы будут более содержательными.