Вам нужно поле ColumnIndex? тогда создавайте классы так:
public partial class Column
{
public int Id { get; set; }
public string Name { get; set; }
public string CodeName { get; set; }
public ICollection<DataWorkBook_Column> Workbooks { get; set; }
}
public partial class DataWorkBook
{
public int Id { get; set; }
public string Name { get; set; }
public int Type { get; set; }
public ICollection<DataWorkBook_Column> Columns { get; set; }
}
public class DataWorkBook_Column
{
public Column Column {get;set;}
public DataWorkBook WorkBook {get;set;}
[Key]
public int ColumnIndex {get;set;}
}