>>> line='\n\n\n641717\n\site.ru\n60\n\nАктивен\n\n\n2005\n\n\n61%\n\n\n\n8%\n\n\n\n\n\n 12.59\n\n\n\n\n 414.63\n\n\n\n 4 712.49\n\n\n\n\n\n'
>>> line
'\n\n\n641717\n\\site.ru\n60\n\n\xc0\xea\xf2\xe8\xe2\xe5\xed\n\n\n2005\n\n\n61%\n\n\n\n8%\n\n\n\n\n\n 12.59\n\n\n\n\n 414.63\n\n\n\n 4 712.49\n\n\n\n\n\n'
>>> import re
>>> re.split(r'\s+',line)
['', '641717', '\\site.ru', '60', '\xc0\xea\xf2\xe8\xe2\xe5\xed', '2005', '61%', '8%', '12.59', '414.63', '4', '712.49', '']
Пустые значения можете фильтровать при итерации по списку:
for item in re.split(r'\s+',line):
if item:
pass
или так:
>>> re.split(r'\s+',line.strip())
['641717', '\\site.ru', '60', '\xc0\xea\xf2\xe8\xe2\xe5\xed', '2005', '61%', '8%', '12.59', '414.63', '4', '712.49']
Использовал python 2.7.