Самый простой способ — регулярки.
console.log('Слово (2000 р)'.replace(/^(.*\()([^\)]+)(\).*)/, '$1<span>$2</span>$3'));
jQuery тут не причём. Я вообще поражаюсь, насколько люди плотно сидят на библиотеках, не видя ничего вокруг.
И пишется
руб., а не
р.
Update: Смотрите
jsfiddle.net/petroveg/rpk4xkj8
Привёл 2 варианта решения задачи, и с помощью CSS ничуть не хуже.