bootstrap-responsive.css во второй версии адаптировал дизайн под маленькие разрешения экрана. т.е. "включал" все фишки верстки, которые менялись в зависимости от разрешения. особенно полезно это было, если сайт проектировался не только под десктопы, но и под мобильные устройства.
в третьей версии они решили этот функционал включить "по умолчанию". Т.е. никаких дополнительных стилей типа bootstrap-responsive.css подключать не нужно - всё уже включено.