никаких ограничений в модулях коммерса быть не может. вы же используете обычные ноды с таксономией.
попробуйте этот модуль: https://www.drupal.org/project/custom_breadcrumbs
довольно гибкая настройка breadcrumbs, поддерживает tokens.
Используется таксономия и search api + facets. К сожалению, ни в каком виде крошки не выводятся во вьюсах, они попросту отключены. В нодах выводятся, все нормально.