На сколько я знаю, программы, которые работают с HealthKit не могут сохранять у себя данные, взятые из фреймворка. Они могут только показывать, строить графики и т.п.
Как сделать бекап или дамп базы HealthKit с iOS устройства?
Пока без джейлбрейка, но рассмотрю все варианты.