Нет, код каждой CMS свят и непорочен, их не программисты делали, они изначально были, есть и будут. Посему - ни в коем случае.
Вообще говоря можно конечно, но не стоит этого делать по вполне конкретным причинам:
* невозможность обновления без ручного мерджа кода.
* сторонние расширения могут вести себя не предсказуемо.
Но если очень хочется - делайте правки в виде обертки.
З.Ы.
xmoonlight дело говорит