репозиторий — это репозиторий доктрины — класс — наследник Doctrine\ORM\EntityRepository
я вас правильно понял? 
нельзя получить параметры из репозитория, разработчики не предусматривали такую возможность.
Потому что так делать будет не правильно. 
В репозиториях живут методы, которые хранят логику сложных выборок данных из БД. Больше ничего им не нужно. А если нужно, у методов — есть параметры. 
FTP — это не БД. 
Я бы для этого рекомендовал вам сделать сервис для этих целей.
А в сервис параметры легко подставляются через конструктор или set-методы через DI-контейнер. 
Посмотрите как они это делают в примере с почтой 
в официальной документации.