Я бы такое хранил в MongoDB, там шарды и репликация идут из коробки.
Т.к. вы сказали несколько разделов, то напрашивается коллекция users с документом, внутри которого будут ссылки на разделы.
Что-то в виде:
{
_id: 992,
sections: [
{section: 24, access: 1, got: timestamp},
{section: 25, access: 0, got: timestamp, lost: timestamp},
]
}
Используя Aggregation Framework вы легко получите требуемые данные.