Хетзнер для серверов дает немного бекап пространства на отдельном сервере. Подробнее по ссылке:
wiki.hetzner.de/index.php/Backup/ru В роботе можно глянуть какой у вас тариф и настроить бекап. Полный бекап сервера бесполезен. Делайте duplicity /etc/ /usr/ /var/ и других нужных директорий, и затем лейте все на FTP хетзнера.