Если логотип изначально с белым фоном - его надо обтравить, или найти уже готовый векторный или уже заранее обтравленный в png. По другому никак, но обтравливать можно самыми разными способами.
Например:
- кликнуть на иконке превью слоя, что бы открыть окно с настройками эффектов слоя
- в группе настроек "Blend if:" сдвинуть верхний ползунок "This layer" на несколько делении влево. это удалит белый фон. на качественном изображении достаточно 254-250, на плохих потребуется двигать дальше
- подложить под слой с логотипом новый пустой слой
- слить оба слоя
Получатся слой без белого фона. Если изображение низкого качества, такая обтравка разлохматит края