это LXС, он нужен для изоляции окружения, необходимого приложению для работы. То есть это такой быстрый способ развернуть приложение не парясь о зависимостях.
Залесть внутрь конечно можно, но проще сделать так:
https://github.com/audreyt/ethercalc
там есть Dockerfile по которому строится и провиженится контейнер.
Вообще фишка докера в том, что это по сути механизм версионизации контейнеров. То есть мы берем один снапшот, изменяем его и сохраняем. Как git для окружения.
Залезать можно по ssh и можно маунтить директории.