MIME можно дополнить расширением.
Астра - это Дебиан, соответственно, гуглим "debian mime add extension".
Получаем, что нужно добавить строчку с glob pattern.
Вот так, например, у меня для своей программы выделяются именно .EPS-файлы (это кусок из скрипта первичной настройки новой рабочей станции):
cat << EOF > ~/.local/share/mime/packages/application-x-epos.xml
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<mime-info xmlns="http://www.freedesktop.org/standards/shared-mime-info">
<mime-type type="application/x-epos">
<comment>EPS file</comment>
<icon name="application-x-epos"/>
<glob-deleteall/>
<glob pattern="*.eps"/>
</mime-type>
</mime-info>
EOF
update-mime-database ~/.local/share/mime