Рабочее решение
подключение к 2-м и более БД
$dbh1 = mysql_connect($hostname1, $username1, $password1);
$dbh2 = mysql_connect($hostname2, $username2, $password2, true);
$dbh3 = mysql_connect($hostname3, $username3, $password3, true);
mysql_select_db('database1', $dbh1);
mysql_select_db('database2', $dbh2);
mysql_select_db('database3', $dbh3);
в запросе указываем к какой БД подключение:
// запрос к базе 1:
mysql_query('select * from tablename', $dbh1);
// запрос к базе 2:
mysql_query('select * from tablename', $dbh2);
// запрос к базе 3:
mysql_query('select * from tablename', $dbh3);