Я не имею понятия как я должна отслеживать числа
Элементарно: на каждой итерации цикла читать число из консоли, условным выражением проверять, что оно больше нуля, выполнять математическую операцию для вычисления среднего арифметического и сохранять результат в переменную.
мы такое не проходили
Тут два варианта вижу: либо скажите тому, кто дал вам это задание, что вы это не проходили, либо возьмите учебник и пройдите.