Допустим я устанавливаю jquery. Bower выкачивает весь репозиторий вместе с папкой src, в которой хранятся исходники jquery. Это куча совершенно не нужных мне файлов, тормозящих IDE.
добавьте директорию с исходниками в игнор. Да и не знаю, если делать bower install jquery то выкачивается вот этот репозиторий: https://github.com/components/jquery