Если основные потребители дискового пространства пользовательские данные, т.е. /home, то я бы отформатировал бы это свободное пространство под раздел с зашифрованными данными, создал бы на нём пользовательские подкаталоги, перенес бы их данные туда, и прописал его монтирование вместо /home.
Другой вариант: установил бы новую версию Ubuntu на свободное место, перенёс данные в свежую систему из старого раздела, затем удалил бы его и расширил за его счёт новый раздел.