angular - для построения приложений, jquery - для работы с DOM. Знаете, бывает такая грустная и печальная ситуация, когда в спецификациях к проекту прописывают очень грустную строчку типа "Supported browsers: IE8+ and last two versions of another browsers". И вот после того как закончишь пускать скупую слезу, открываешь консоль, переходишь в директорию проекта и пишешь: bower install --save jquery.
Суть не в дурацких jQuery плагинах (хотя и это может быть вполне себе веской причиной), а в том что jQuery предоставляет чертовски удобное API для работы с DOM, которое содержит в себе огромную кучу кастылей только ради того, что бы вы не думали о тех нюансах, которые могут вас подстерегать при казалось бы банальных вещях.
На своих проектах, которые реализуются под десктопные браузеры, я всегда подключаю jQuery, только потому что обжегся уже несколько раз при использовании API браузера в чистом виде. Иногда там такие интересные особенности закрадываются, которые без пары лет опыта работы и не узнаешь, а тратить деньги клиента только потому что "jQuery это уже не круто" и потом впустую просирать время за долгими ночными дебагами, имхо дебилизм.