Предотвращение - немедленно делать то, что советует Atlassian.
Обнаружение атак - в общем случае можно сделать алерт, если объем лога за минуту (10 минут, час) значительно вырос. Обычно есть 100 записей в минуту - будем посылать алерт если есть 300.
Плюс прочитать что пишет Atlassian и настроить алерты по ключевым словам (URL, requests, ...) которые используются в аттаках.
Если отвлечься от Atlassian и говорить в целом - чтобы не изобретать велосипед, нужен WAF (web application firewall). Я последние годы 99% в облаке, но если вы нет, наверняка есть и on-prem products.
Примеры облачных WAF - AWS WAF (ACL), Cloudflare. Мы получаем набор правил от провайдера WAF, который сделан на основе анализа огромного траффика и должен отфильтровывать "плохой" траффик. Разумеется, набор обновляется в реальном времени.
Так что слова для поиска: WAF, SIEM, IDS.