У меня MacBook Pro Retina, таких вещей не замечал, однако уже заменили материнскую плату, была проблема с дискретной видео картой.
А зависания обычно происходят только если приложение завершилось не удачно, и вылезло окно об ошибке, несколько секунд нельзя ничего сделать с ним... (медленно собирается статистика о происшествии).
В вашем случае, предлагаю обратиться в сервисный центр, возможны проблемы с SSD.