могут ли эти "гости" как то скрыть свое присутствие от меня и от системы
Нет, если они не авторизовались в системе или в приложении - сервере, которое слушает какой то порт даже если этот порт открыт. Но проблема в другом, если какой то порт открыт, то некоторые начинают его брутфорсить, пытаясь подобрать пароль грубым перебором, что не очень здорово с точки зрения безопасности и создаёт ненужный паразитный трафик и нагрузку на сервер.
Выход - поставить fail2ban, который автоматом блокирует IP после нескольких неудачных попыток авторизации с него.